Puede que el motor haya entrado en modo de funcionamiento de emergencia, por algún problema en el sistema de inyección, con la EGR, con el caudalímetro, o con el sistema de descontaminación (filtro de partículas, en caso de llevarlo). Esto último es muy frecuente si el filtro se colapsa y no regenera bien.
El humo negro es señal de que la combustión no se está produciendo de forma adecuada, bien hay un exceso de combustible o una falta de oxígeno, por lo que me inclino por un problema en la inyección o en la EGR, que no se cierra al pisar el acelerador a fondo, y el gas de escape sigue mezclándose con aire recirculado a través de la EGR, con menos contenido en oxígeno. Por eso el gasóleo no se quema por completo y sale el humo negro.
Otras posibilidades son el caudalímetro en mal estado, filtros de aire demasiado sucios, o algún inyector defectuoso.